Опыт внедрения АБиоГрам в НМИЦ ЛРЦ: замкнутый цифровой контур АМР-мониторинга. Как перейти от «ручных сводок» к валидированным данным и аналитике в реальном времени?

Содержание
Общая информация о публикации
Название: «Опыт создания замкнутого цифрового контура для обеспечения непрерывного мониторинга антимикробной резистентности на основе валидированных результатов микробиологической диагностики»
Авторы: Гультяева Н.А., Виноградова А.Г., Колесникова И.В., Рыжова К.А., Шелковникова О.В.
Журнал: Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия (КМАХ), 2025, том 27, №3, стр. 369–389
DOI: 10.36488/cmac.2025.3.369-389
Публикация описывает практический кейс, где микробиологическая служба «пересобрана» в замкнутый цифровой контур: от регистрации пробы и стандартизированного определения чувствительности до валидированного заключения, накопления структурированных данных (включая метаданные) и непрерывной аналитики АМР для поддержки локальных протоколов эмпирической АМТ.
Скачать материалы
- PDF статьи:
⬇️ Скачать статью (PDF)
Ссылка для цитирования
Гультяева Н.А., Виноградова А.Г., Колесникова И.В., Рыжова К.А., Шелковникова О.В. Опыт создания замкнутого цифрового контура для обеспечения непрерывного мониторинга антимикробной резистентности на основе валидированных результатов микробиологической диагностики. КМАХ. 2025;27(3):369–389. DOI: 10.36488/cmac.2025.3.369-389
Почему это важно
Почти в каждой медицинской организации «узкое место» одно и то же: данные по микробиологии есть, но они:
- разрознены (разные журналы/ЛИС/форматы),
- требуют ручной курации,
- плохо переиспользуются для мониторинга и обновления локальных рекомендаций.
В проекте авторов ключевой результат — переход от эпизодического ручного мониторинга к непрерывному цифровому анализу в реальном времени, основанному на валидированных данных. Основой данного процесса и единицей данных является цифровое микробиологическое заключение. Оно формируется автоматически на основе постоянно обновляемых критериев и содержит структурированные комментарии, поясняющие интерпретацию результата.
Цель, дизайн и что именно внедрили
Цель: внедрить замкнутый цифровой контур для непрерывного АМР-мониторинга на основе валидированных результатов микробиологической диагностики.
Период: май 2024 — сентябрь 2025 (проспективное исследование).
Что сделали (по шагам):
- Провели аудит исходного состояния и SWOT-анализ.
- Реструктурировали ПО и поток данных, оптимизировали процессы.
- Стандартизировали методики в соответствии с рекомендациями EUCAST.
- Внедрили интегрированную систему: ЛИС (с микробиологическим модулем) + АБиоГрам.
Что считается «замкнутым контуром» в этом кейсе
Контур — это не просто «передали результаты в МИС». Это цикл, где:
- микробиология → формирует данные и запрос в АБиоГрам,
- микробиолог → валидирует и формирует финальный документ,
- система → накапливает данные + метаданные и строит отчеты,
- на основе отчетов → обновляются локальные рекомендации по эмпирической АМТ (с доступом для врачей),
- продукты цикла: валидированное заключение с комментариями и протокол эАМТ.
(Схема цикла приведена в статье на рис. 13.)

Ключевой «кирпич» контура: метаданные и стандартизация полей
Авторы отдельно подчеркивают важность метаполей для обмена между ЛИС и АБиоГрам (табл. 3): ID пациента/пробы, возраст, пол, отделение, цель исследования (диагностика/скрининг), клинические признаки (например, «дольше 3 дней в ОРИТ»), диагноз инфекции и др.
На базе этих полей построены фильтры пользовательского интерфейса (рис. 2), которые формируют выборку для анализа (дата, цель, диагноз, отделение и т.д.) и позволяют выполнять как «простую структуру», так и многофакторный анализ с поиском корреляций.
Результаты внедрения: что реально изменилось
1) Автоматизация и валидация антибиотикограмм
Внедрение АБиоГрам позволило:
- автоматизировать экспертную оценку и валидацию антибиотикограмм,
- обеспечить непрерывный поток структурированных данных (включая метаданные),
- перейти к мониторингу и анализу в режиме реального времени.
2) Проспективный мониторинг без «ручной курации»
Авторы демонстрируют возможность проспективного мониторинга без необходимости постоянной ручной «чистки» данных — за счет стандартизированного ввода, метаданных и цифровой валидации.
3) Многофакторный анализ: резистентность + факторы риска
Продемонстрирован многофакторный анализ, направленный на поиск корреляций между резистентностью ключевых возбудителей и метаданными факторов риска.
4) Экспертные комментарии в заключении — и как их восприняли врачи
Важная часть нового бланка заключения — автоматическое присвоение и репортирование экспертных комментариев АБиоГрам, основанных на актуальных критериях EUCAST/CLSI и библиотеке экспертных правил.
Примеры типов комментариев, приведенных авторами:
- Коррекция чувствительности на основе индикаторного препарата
- Неясная терапевтическая эффективность
- Предупреждение об ожидаемой устойчивости
- Предупреждение о риске развития резистентности
- Предупреждение о редком фенотипе
- Экстраполяция результатов
Опрос врачей показал:
- 89,4% обращают внимание на комментарии и читают их;
- 91,5% считают, что комментарии помогают принять решение по выбору антибиотика при отсутствии возможности обратиться к консультанту;
- 53,2% оценили комментарии как понятные (8–10 баллов по 10-балльной шкале), еще 27,7% отметили, что иногда нужны разъяснения.
«До/после» в одной таблице: что изменилось в процессах
В статье есть сравнительная таблица состояния микробиологической диагностики и мониторинга АМР до и после внедрения (табл. 4). Среди примеров «до»: бумажные журналы, рукописные направления с минимумом данных, раздельный учет стационара и амбулатории, устаревшее ПО и ручной ввод результатов. После внедрения — цифровая регистрация заказа в ЛИС/МИС, цифровой журнал этапов исследования, расширенное направление с полями единичного выбора и перенос метаданных.
Что позволил сделать АбиоГрам: итоговая таблица
| Направление | Что было «до» (типично) | Что позволил сделать Абиограм (в контуре ЛИС–Абиограм–МИС) | Практический эффект |
|---|---|---|---|
| Валидация антибиотикограмм | Ручная экспертная проверка; вариабельность интерпретации; задержки | Автоматизировать экспертную оценку и валидацию антибиотикограмм на базе правил и актуальных критериев интерпретации | Меньше ошибок и задержек; единая логика заключений |
| Единые правила и стандарты | Разные подходы между сотрудниками/сменами; сложно контролировать версии | Централизовать и автоматизировать правила интерпретации и комментарии, поддерживать актуальность (EUCAST/CLSI-логика в правилах) | Стабильное качество, воспроизводимость решений |
| Метаданные и структурирование | Минимум полей; рукописные/свободный текст; сложно строить выборки | Ввести и использовать стандартизированные метаполя (цель, отделение, диагноз, факторы риска и т.д.) и обеспечить их перенос между системами | Аналитика становится «клинической», а не просто “S/I/R” |
| Непрерывный мониторинг АМР | Эпизодические «ручные сводки»; отчёты не в реальном времени | Обеспечить непрерывный поток валидированных данных в аналитический контур и мониторинг в режиме реального времени | Быстрее реагирование на изменения АМР и всплески |
| Сегментация (фильтры) и когорты | Сложно разделить стационар/амбулаторию, отделения, диагнозы; много ручной работы | Реализовать фильтры/когорты по дате, цели, диагнозу, отделению и др. для «простого» и многофакторного анализа | Быстрая аналитика по подразделениям/сценариям |
| Многофакторный анализ (АМР + риск-факторы) | Ограничивается простыми процентами; корреляции почти недоступны | Проводить многофакторный анализ и искать связи резистентности с контекстом и факторами риска (через метаданные) | Более точные локальные рекомендации и интервенции |
| Экспертные комментарии в бланке | Комментарии не стандартизированы, зависят от человека | Автоматически присваивать и отображать экспертные комментарии (коррекция по индикаторному АМП, предупреждения, экстраполяция, природная резистентность и т.д.) | Поддержка клинициста «в моменте», особенно при отсутствии возможности обратиться к консультанту |
| Коммуникация с клиницистами | Результат «как есть»; ограниченная интерпретируемость | Сделать заключение более «клинически читаемым» за счёт стандартных комментариев и правил | Выше доверие и применимость результатов |
| Отчёты и обновление локальных протоколов | Обновление протоколов редко, вручную, без прозрачных данных | Сформировать контур, где отчёты и аналитика используются для обновления локальных протоколов эмпирической АМТ | Протоколы опираются на локальные валидированные данные |
| Цифровой след и управляемость процесса | Журналы/таблицы, сложно проследить этапы и качество | Вести цифровой контур: от регистрации до финального заключения и вторичного использования данных | Управляемость, аудит, качество сервиса и данных |
Итог: Абиограм в составе интегрированного контура превращает микробиологию из “производства результатов” в устойчивый источник валидированных данных и аналитики, на которых можно регулярно обновлять локальные решения по эмпирической АМТ.
Практический вывод для руководителя/заведующего/клинфарм-контура
Смысл кейса можно сформулировать так:
Всё начинается с цифрового микробиологического заключения и поясняющих комментариев — это первичная единица. Только когда эти данные валидированы, структурированы и автоматически попадают в аналитику, АМР-мониторинг становится устойчивым. Микробиологическая служба перестает быть «производством результатов» и становится центром экспертизы и данных для локальных решений по эмпирической и этиотропной АМТ.