Интерактивная карта доказательств: факторы риска и прогностические модели антимикробной резистентности
Дополнительный материал к систематическому обзору. Данные организованы по отдельным аналитическим разделам: факторы риска, количественные оценки ассоциаций, прогностические модели, сопоставление клинических доменов и методологическое качество.
Публикация
Факторы риска и прогностические модели наличия бактериальных возбудителей с клинически значимыми фенотипами антимикробной резистентности: систематический обзор
Работа с визуализациями: графики и таблицы можно развернуть почти на всё окно браузера кнопкой «Развернуть» и вернуть к исходному размеру кнопкой «Свернуть» или клавишей Esc. Для графиков доступны PNG и SVG; для таблиц можно изменить число строк на странице.
первичных исследований в основном синтезе
исследований факторов риска
исследований прогностических моделей
аналитических единиц карты факторов риска
модельных единиц основного анализа / всего в карте
строк факторов риска с количественной оценкой
моделей воспроизводимы / почти воспроизводимы
моделей с внешней или временной валидацией
Общая динамика публикаций
Все включённые публикации: 317 исследований факторов риска и 65 исследований прогностических моделей. График относится ко всей выборке и не зависит от фильтров других вкладок.
Структура дашборда
Факторы рискаКарта фенотипов и клинических событий, частота изучения факторов, представленность сочетаний и динамика выбранной подгруппы.
Количественные оценкиИндивидуальные OR/RR/HR/IRR без объединённой оценки, согласованность направления и таблица исходных оценок.
СопоставлениеСравнение гармонизированных клинических доменов в исследованиях факторов риска и прогностических моделях.
Качество и данныеQUIPS, PROBAST+AI, реестры исследований и моделей, а также глоссарий.
Факторы риска
Интерактивное представление обновлённой карты доказательств S05. Таблицы 1–3 карты включают сочетания с k ≥ 1, а повторно изученные сочетания в таблице 4 определяются при k ≥ 2. Фильтры этой вкладки не изменяют количественные оценки и раздел прогностических моделей.
повторно изученных сочетаний с k ≥ 2
сочетаний, представленных ровно в 2 исследованиях
сочетаний, представленных в ≥ 3 исследованиях
Фильтры факторов рискаПрименяются к графикам этой вкладки и к реестру исследований факторов риска во вкладке «Качество и данные».
Каскад: фенотип → клиническое событие → условия оказания помощи → возрастная группа. В каждом поле доступен множественный выбор.
Карта «фенотип × клиническое событие»
Размер круга – число независимых исследований; цвет – доля исследований хотя бы с одной скорректированной количественной оценкой. Нажатие на круг переносит выбранные фенотип и событие во вкладку «Количественные оценки».
Показатель меняет тепловую карту; минимальное число исследований применяется также к графику доступности скорректированных оценок. По умолчанию выбран k ≥ 2 – порог повторяемости из таблицы 4 карты S05; он не является порогом достаточности для метаанализа.
Наиболее изученные факторы по фенотипам
Показатель и порог представленности задаются над графиками.
Число исследований и доступность скорректированных оценок
Каждая точка – сочетание «фактор × фенотип × клиническое событие». По оси X – число исследований, по оси Y – доля исследований со скорректированной оценкой.
Матрица показывает число независимых исследований для всех сочетаний выбранных фенотипов и клинических событий, включая нулевые ячейки. Категории: 0, 1–2, 3–5 и >5 исследований.
Динамика исследований факторов риска в выбранной подгруппе
Число независимых публикаций по году после применения фильтров вкладки «Факторы риска».
Количественные оценки ассоциаций
Индивидуальные опубликованные оценки представлены без статистического объединения.
Фильтры количественных оценокНезависимы от фильтров вкладки «Факторы риска».
Каскад: фенотип → клиническое событие → условия оказания медицинской помощи → фактор риска → мера эффекта. Последующие списки учитывают объединение выбранных значений.
Индивидуальные количественные оценки ассоциаций
Без объединённой оценки. Показаны отдельные OR/RR/HR/IRR. При наличии пригодного 95% ДИ он отображается горизонтальным интервалом; оценки без пригодного ДИ – отдельной точкой. Вертикальная линия соответствует значению 1.
Форма точки по итоговой оценке QUIPS: ● низкий■ умеренный▲ высокий◇ нет сопоставимой оценки.
Согласованность направления опубликованных ассоциаций
Для сочетаний «фактор × фенотип × клиническое событие» показано число количественных оценок выше и ниже нейтрального значения 1, а также число 95% ДИ, пересекающих 1. Сочетания с одной доступной оценкой показывают направление отдельной оценки, но не согласованность между исследованиями.
Таблица количественных оценок
Таблица следует фильтрам этой вкладки и содержит исходные индивидуальные количественные оценки.
Прогностические модели
Карта S06 содержит 102 самостоятельные модельные единицы из 65 публикаций: 90 относятся к основному синтезу наличия АМР-фенотипа, 8 – к вторичным клиническим исходам, 3 – к контекстным/агрегированным моделям и 1 – к небактериальной области. Интерактивные аналитические графики этой вкладки сохраняют фокус на 90 модельных единицах основного синтеза.
Фильтры прогностических моделейПрименяются к методическим подходам, показателям дискриминации, анализу предикторов, карточке модели и реестру моделей. График полноты представления характеризует 90 модельных единиц основного синтеза и не фильтруется.
Каскад: целевой фенотип → тип модели. Допускается множественный выбор.
Фильтры предикторовПрименяются только к под-вкладкам «Предикторы» и «Количественные параметры».
Каскад: выбранные фенотипы и типы моделей → домен → конкретный предиктор. Для гармонизированных признаков используется русское наименование; исходная формулировка сохраняется в таблице.
Методические подходы
Показаны число модельных единиц и число независимых публикаций.
Полнота представления и воспроизводимость
Сводная характеристика 90 модельных единиц основного синтеза из 102 модельных единиц, отражённых в S06; этот график не зависит от фильтров целевого фенотипа и типа модели.
Сообщённые показатели дискриминации
Индивидуальные значения AUC/AUROC/C-index; статистическое объединение не выполняется. Для неоднозначных агрегированных диапазонов одной публикации точки не создаются автоматически.
Предикторы прогностических моделей
Частота включения отражает представленность признака в финальных моделях, а не величину его прогностического вклада.
–модельных единиц с предикторами
–связок «предиктор–модель»
–независимых публикаций
–связок с числовым параметром
Конкретные предикторы: частота включения
Число модельных единиц и независимых публикаций, где признак входил в финальную модель.
Домены предикторов по фенотипам
В ячейке – число уникальных модельных единиц, содержащих хотя бы один предиктор данного домена.
Распространённость предиктора и полнота количественного описания
По оси X – число модельных единиц, включавших предиктор; по оси Y – доля связок «предиктор–модель», для которых опубликован числовой параметр. Размер точки – число независимых публикаций.
Числовые параметры отдельных предикторов
OR показаны на логарифмической шкале с 95% ДИ, если он доступен. Коэффициенты модели и баллы шкал выводятся на собственной линейной шкале. Значения относятся к конкретным моделям и не объединяются между моделями.
Сопоставление факторов риска и предикторов прогностических моделей
Сопоставление выполнено на уровне гармонизированных клинических доменов во всей выборке и не зависит от фильтров других вкладок. Для исследований факторов риска публикация учитывается в пределах домена однократно независимо от числа изучавшихся факторов; для прогностических моделей модельная единица учитывается однократно при наличии хотя бы одного финального предиктора соответствующего домена.
Сводное сопоставление двух направлений обзораСовпадение домена не означает равенства величины эффекта, причинной значимости или прогностического вклада.
Представленность клинических доменов
Для каждого домена показана доля 317 публикаций исследований факторов риска и доля 90 модельных единиц основного синтеза. Публикация учитывается в пределах гармонизированного домена однократно независимо от числа изучавшихся факторов; модельная единица – однократно при наличии хотя бы одного финального предиктора домена.
Каждая точка – гармонизированный клинический домен. Ось X показывает долю публикаций исследований факторов риска (n = 317), в которых представлен домен; ось Y – долю модельных единиц основного синтеза (n = 90), содержащих финальные предикторы этого домена. Диагональ соответствует одинаковой относительной представленности. Цвет точки показывает разницу между долями в процентных пунктах: положительное значение означает большую представленность в исследованиях факторов риска, отрицательное – в прогностических моделях. Положение точки не характеризует силу ассоциации или прогностическую значимость. Остаточная категория «Прочие / комплексные признаки» в сопоставление не включена.
Качество и данные
Методологические оценки и полные реестры вынесены в отдельную вкладку, чтобы не смешивать их с аналитическими графиками.
QUIPS
Реестр исследований факторов риска
Одна строка соответствует аналитической единице «публикация × стандартизированный фактор × фенотип × клиническое событие». Таблица следует фильтрам вкладки «Факторы риска».
Реестр прогностических моделей
Таблица следует фильтрам вкладки «Прогностические модели».
Самостоятельное прогностическое решение внутри публикации, отличающееся целевым исходом, алгоритмом, набором предикторов либо статусом разработки/валидации.
Скорректированная оценка
Количественная мера ассоциации, полученная авторами в многофакторной модели, например OR, RR, HR или IRR.
Воспроизводимость модели
Возможность независимо воспроизвести расчёт индивидуального прогноза по опубликованной статье и доступным дополнительным материалам; не является синонимом высокой прогностической точности.
Представленность сочетаний
Число исследований для сочетаний фенотипа резистентности и клинического события. Нулевая или малая представленность означает недостаток опубликованных данных, а не отсутствие клинической значимости.